La combinación de tecnologías no invasivas y convencionales podrían completar vacíos de información ecológica imprescindibles para apoyar estrategias de conservación de especies amenazadas. Una de las especies más amenazadas en el occidente de Cuba es Natalus primus, la que presenta uno de los menores grados de distribución en el mundo. Esta especie, ahora en peligro crítico de extinción, presenta grandes vacíos de información que entorpecen su protección a largo plazo. El objetivo principal de este trabajo fue analizar la eficacia de métodos de estudios convencionales y con tecnología no invasiva, en la colecta de información ecológica de Natalus primus, uno de los murciélagos más amenazados de Cuba. Los principales resultados mostraron que, la población de N. primus se mantiene relativamente estable con una densidad relativa media de 576 ejemplares. N. primus abandona el refugio diurno en un período comprendido entre 30 y 50 minutos después de la puesta del sol, recorriendo senderos específicos y evitando las altas densidades de otras especies. La Familia Natalidae presentó los menores valores de densidad con solo el 5.3% del total de la colonia. El uso de redes de niebla para la captura de N. primus demostró ser un método poco eficiente en estudios de uso de hábitat, mientras que el uso de jamos entomológicos dentro del refugio se ratificó como el método principal para la captura de ejemplares.